基础医学实验中心由解剖实验室、机能实验室、病理实验室、免疫微生物实验室和生物化学实验室组成，承担医学院基础课程的实验课。本中心占地面积520平米，固定教学资产400余万元。
一、解剖实验室
解剖实验室总面积220平方米，170万元教学设备。包括大体数码互动实验室2间，每间实验室平均面积80平方，40平方米的标本陈列室展厅一个，20平方米的实训准备室一间。
大体数码互动实验室配备有数字人数码互动系统和冷藏抽风式尸体解剖实验台，包含有大体标本、整体肌肉、血管神经、内脏和人体各部位、器官等大小件标本；骨骼标本、生物塑化整体和小件标本；血管和器官管道铸型标本；三维断层标本和树脂包埋切片标本；各系统瓶装陈列标本200多件；还有各系统的解剖模型等教学标本和设施。
本实验室承担了医学院全部专业《解剖学》、《正常人体结构》等课程的教学任务。
二、机能实验室
本实验室共有两间，共120㎡。现有生物机能实验同步演示系统1台，生物信号采集与分析系统8台，恒温平滑肌实验系统6台，以及其他大型设备如分析天平分光光度计，低温高速离心机等。还包括有眼科剪、止血钳、解剖镊、毁髓针、蚊氏止血钳等解剖工具。
机能实验室现有教师3人，副教授1人，助教1人，实验员1人。教师中具有博士学位1人，硕士学位2人。实验室承担3年制临床、护理、康复等专业的《药理学》与《生理学》课程的实验教学工作。本实验室实验课的开设旨在使学生们掌握动物实验的基本要求，强化和加深学生对生理药理学基本理论和知识的认识，熟悉生理药理学实验研究的常用方法和结果的处理方法，为今后的临床工作奠定初步的基础。
本实验室主要开设的实验项目有：刺激强度和刺激频率与骨骼肌收缩的关系、兔呼吸运动的调节及影响、家兔动脉血压的调节及药物对动脉血压的影响、家兔尿生成的影响因素及利尿药的影响、影响离体平滑肌收缩的因素及药物对其的作用
三、病理实验室
本实验室面积60㎡，现有带电源双目显微镜44台，奥林巴斯显微图像摄影仪两套，示教用大体标本一套169个，切片（包括正常组织，病变组织，微生物）162种共计19440张。
病理学实验室现有教师3人，副教授1人，助教1人，实验员1人。教师中具有硕士学位2人。实验室承担3年制临床、护理、康复等专业的《病理学》与《组织胚胎学》课程的实验教学工作，以及常见疾病病理切片诊断工作。
本实验室实验课的开设旨在帮助学生学会显微镜的使用，学习细胞的微观结构，了解疾病状态下微观结构的表现，从而理解疾病的临床表现。培养学生的动手能力，观察能力，分析能力，建立临床病理联系。
四、免疫微生物实验室
本实验室面积60㎡，现有带电源双目显微镜44台，奥林巴斯显微图像摄影仪两套，示教用医学标本玻片一套共162种，双人位超净工作台2个，紫外可见分光光度计1台，超纯水处理器1台，高速冷冻离心机1台，真空恒温干燥箱1台，高压灭菌锅1台，霉菌培养箱1台，超声波清洗机2台，电子分析太平1台等。
免疫微生物实验室现有教师3人，教授1人，讲师1人，实验员1人。本实验室承担3年制临床医学专业的《病原生物学与免疫学》课程的实验教学工作。本实验室实验课的开设旨在帮助学生学会微生物培养及观察过程中的灭菌、接种、培养、染色等操作，学会观察微生物的微观结构，掌握显微镜的使用、消毒及灭菌操作等。通过实验使学生理论联系实际，培养严谨的科学态度、独立思考、实践创新的能力，提高学生的实践能力和解决问题的能力。
本实验室开展的实训项目主要包括：细菌的形态与结构、细菌的接种与生长现象、微生物的分布与消毒灭菌等。
五、生物化学实验室
本实验室面积60㎡，现有低速离心机2台，高速离心机1台，电泳仪2台，电子分析天平1台，可见分光光度计2台，干燥箱1台，超纯水处理器1台，恒温水浴锅4个，超声波清洗机2台，磁力搅拌器4台等。
生物化学实验室承担3年制临床医学专业的《生物化学》课程的实验教学工作。本实验室实验课的开设旨在帮助学生学会基础仪器设备的使用，学会从分子水平探讨生命现象的本质，学习运用生物化学的科学思维，从而为其他医学各学科从分子水平上研究正常和疾病状态时人体结构与功能乃至疾病的预防、诊断及治疗，提供理论和技术。通过实验让学生做到理论联系实际，培养发散思维、动手能力，观察能力及分析能力等。
本实验室主要完成以下实验：蛋白质的两性反应及等电点的测定、蛋白质的胶体性质、变性、盐析、酵母RNA的提取及成分鉴定（浓盐法）、血清葡萄糖含量的测定、血清总胆固醇含量的测定等。
